郭靖從小是江南六怪教導長大的，對待他們就像對待親生父母一樣愛戴，然而，江南六怪中有五人被歐陽鋒和楊康所殺，只剩下柯鎮惡一人可以讓郭靖養老送終，留下了終生遺憾。
關于這次仇殺，中間還有個烏龍事件，就是由于五怪死于桃花島，郭靖開始誤會是黃藥師所為，郭靖憤怒異常，當即就決心找黃藥師報仇，甚至跟黃蓉也斷絕關系，勢不兩立。后來誤會解除，郭靖知道了真兇，雖然也沒有放棄報仇，但是態度卻平和很多，這又是為什么呢？
實際上，如果放在常人角度考慮這個問題，倒是不難理解。郭靖雖然是天下一等一良善忠厚之輩，但他也是凡人，也有普通人的喜怒哀樂。他跟黃藥師的不尋常關系，決定了當他認為黃藥師是兇手的時候，有著十分激烈的反應。
郭靖跟黃藥師是對翁婿，都說丈夫娘看女婿，越看越喜歡，但是老丈人和女婿，經常是不對付的。而黃藥師對郭靖，格外不滿意，甚至后來所有誤會解除，他對郭靖始終熟絡不起來，因為兩人就不是一路人。
黃藥師號稱東邪，是天下最古怪刁鉆之人，而且黃藥師天資絕頂，不僅武功高強，而且各種琴棋書畫，五行八卦，無所不精。如此一個人，自然是相當高傲了，根本就瞧不上別人。普通老丈人都容易對女婿有敵對情緒，何況是黃藥師對郭靖了，郭靖除了對女兒好之外，在黃藥師看來一無是處，長得土氣，笨頭笨腦，不善變通，總之沒有優點。而且像黃藥師這種人，從來不會掩飾自己情緒，所以一見面就對郭靖表達了極大的蔑視。
當然了，郭靖是最忠厚老實之人，他對黃藥師這樣的態度并沒有任何想法，他的想法很簡單，就是喜歡黃蓉，要對黃蓉好。后來郭靖的師父江南六怪跟黃藥師見面了，江南六怪雖然名氣不小，但是在黃藥師眼里卻是狗屁不是，自然對他們也表示了一番鄙視。江南六怪雖然也是脾氣火爆之人，但是他們知道東邪素來脾氣古怪，而且為了徒兒的終身大事，為了一時之氣跟黃藥師鬧翻不值得，所以就忍了下來。對于這些事情，郭靖雖然沒有說什么，心里其實是清楚的。想想看，如果今天談戀愛，女方家庭瞧不起男方，如果男方很愛女孩，可以忍受下來，但是如果女方家庭接著侮辱男方父母，有哪個男人可以忍受呢。郭靖對六怪就像對待父母一樣敬愛，雖然書中沒有寫郭靖心態，但想必是十分難受的。
好在那個時候交通不便，很多情況下男女雙方家庭也見不了幾次面，偶爾接受次侮辱也就罷了。但是，當五個師父被害之時，不論是柯鎮惡的證詞還是當時的表面證據，全都指向兇手是黃藥師。郭靖徹底暴怒了，你黃藥師瞧不起我，瞧不起我師父，那你就可以大開殺戒嗎。而且明知道我和女兒交好，你卻殺我師父，這不是明顯的打臉嗎。所以仇恨、屈辱、憤怒各種情緒涌上心頭，讓郭靖都有些失控了，甚至連帶這黃蓉都一起恨上了。
而那個時候，黃蓉很愛郭靖，當然不希望自己和郭靖鬧翻，而且她十分聰明，看了現場就發現很多破綻，兇手大概率不是父親。她極力給父親辯解，但是這次郭靖卻絲毫沒有以往的冷靜和理智，根本就不聽她解釋。書中說郭靖是因為跟師父們感情太深而失控，但實際上有個原因沒有說，那就是他對黃藥師是有積怨的，雖然他心性淳樸以前沒有想那么多，但是這次死人事件讓他瞬間就有了情緒，所以才表現的出離的憤怒。如果當時一開始指向兇手就是歐陽鋒，他反而不會失控，而是很快平復下來，再去謀劃報仇的方法。
當然了，由于郭靖太忠厚，知道事情真相以后，他馬上就把這種仇恨化作了對黃蓉和黃藥師的愧疚，特別是知道黃蓉為了揭露真相不惜做歐陽鋒的人質，他對黃蓉的愛馬上就占了上分。
當然了，還有一個原因，就是在殺江南五怪這件事里，他其實只能算是個執行者，最終的主謀是楊康。當時歐陽鋒為什么跑去桃花島呢，他是聽說全真七子要去找黃藥師決斗，他覺得這是漁翁得利的好機會。沒想到島上沒有黃藥師也沒有全真七子，卻遇到了江南六怪，對六怪這種角色，歐陽鋒不放在心上，但是楊康就不同了。
楊康自從跟郭靖認識以來，十分嫉妒這個義兄，因為郭靖看起來樣樣不如他，最后發展得卻比自己好得多，武功更是楊康無法比擬。看到了郭靖師父，他馬上想出了一個詭計，殺死江南六怪，嫁禍黃藥師。于是西毒穿上黃藥師衣服，戴上面具，他倆一塊對六怪下手，而且楊康還故意留下眼睛瞎了的柯鎮惡，好讓自己的嫁禍留個人證。
其實依著西毒脾氣，雖然看江南六怪不爽，直接殺了就完事，他還不屑于做這種嫁禍的事情。不過既然是楊過提出來的，而且還能給黃藥師制造些麻煩，西毒就無所謂了。
郭靖知道整個事情經過，自然也就知道了楊康其實是主謀，但是這個主謀卻多行不義必自斃，慘死在西毒歐陽鋒的蛇毒之下，整個過程十分凄慘。主謀已經得此下場，再加上那時候他更關心黃蓉的安危，對西毒的仇恨自然也就淡了一些。
當然了，雖然主謀是楊康，但是沒有西毒協助，楊康也根本殺不了江南六怪，所以郭靖仍然沒有放棄給師父們報仇，實際上，再遇歐陽鋒的時候，郭靖直接就說了會找他報仇，而且兩人直接就交手了。
但是那時候郭靖最關心的黃蓉卻沒在歐陽鋒身邊，這讓郭靖又安心又不安心，安心的是黃蓉沒有死，不安心的是黃蓉找不到，她始終有可能再落入歐陽鋒手里，所以他才跟歐陽鋒定下了約定，只要歐陽鋒不傷害黃蓉，自己就可以饒歐陽鋒三次不死。要知道，那時候歐陽鋒雖然武功高于郭靖，但是郭靖有蒙古千軍萬馬，也有丐幫三大長老協助，對上歐陽鋒他其實占據上風。
正是由于這個約定，郭靖幾次捉到歐陽鋒卻又放了他。最終這個過程中他與黃蓉再相會，內心的喜悅更是沖淡了一部分仇恨。
而長期的在蒙古大軍中打仗，死傷無數，讓善良的郭靖產生迷茫，他不知道殺這么多人對不對，甚至對學武產生懷疑，這個坎如果過不去，他學武生涯可能就中斷了。后來還是洪七公教訓裘千仞的時候點醒了他，只要行俠仗義，懲奸除惡，殺人也未嘗不可。不過，這段思索讓郭靖的思想越來越成熟，對于個人恩怨看得不是那么重了。
而很快，華山論劍來了，那時候歐陽鋒逆練九陰真經，腦子已經練壞了，但正因為如此，招式奇特，反而無人能敵，甚至東邪北丐兩人才能與之對抗，當然了，這時候如果郭靖上去他們三個肯定可以殺死歐陽鋒。可是這個時候歐陽鋒已經神志不清了，殺了他又能如何，何況這個仇是郭靖跟歐陽鋒的，郭靖那時候根本也打不過歐陽鋒，借助兩個長輩的手對付一個神志不清的人，的確勝之不武。隨后，隨著歐陽鋒的發瘋跑掉，報仇的事就再次擱置。
當然了，郭靖并沒有忘記這段仇恨，他在《神雕俠侶》里面武功大成，再次相遇歐陽鋒時直接就動上了手，但是兩人勢均力敵，誰也沒討得便宜。不過那時候歐陽鋒依然是個瘋子，郭靖對報仇就沒有什么執念。后來歐陽鋒跟洪七公這對老對頭雙雙隕落華山之巔，這段恩怨算是徹底了結。